Ponte di Nona è collegata, su gomma, dalla via Collatina, la via Prenestina, e la bretella Roma-L'Aquila (A24).
In particolare, la via Collatina collega Ponte di Nona, verso Roma-centro, ai quartieri La Rustica, Tor Sapienza, via Togliatti, via Serenissima. Nella stessa direzione si accede al Grande Raccordo Anulare (5km). All'inverso, in direzione esterna, si raggiunge la cittadella di Lunghezza e Castelverde, Guidonia, Tivoli.
Tutte e tre queste direttrici (Collatina, Prenestina e A24) di collegamento sono purtroppo inadeguate a smaltire il flusso di pendolari che al mattino e al pomeriggio si recano all'interno del G.R.A. La situazione, dai primi tempi nel 2005, è migliorata con l'apertura dello svincolo di Ponte di Nona della Roma-L'Aquila (prezzo del pedaggio: 80 centesimi), l'apertura di via Noale quale parallela alla Collatina per raggiungere il G.R.A., l'approntamento della rotonda di via Cicali per lo smaltimento del traffico in entrata e in uscita dal quartiere. Sono inoltre in corso i lavori di ampliamento della sede viaria, banchinamento, ecc. avviati il 7 ottobre 2009. Prevista inoltre la rotatoria all'incrocio di via di Salone. Queste migliorie, a lungo richieste dagli abitanti del quartiere, che dal 2005 scendono in piazza e fanno manifestazioni per denunciare la situazione, sono state finalmente avviate successivamente all'elezione nel consiglio dell'VIII municipio del Sig. Massimo Mancuso, pontenonino da sempre impegnato nella denuncia delle situazioni di degrado del quartiere, e nell'organizzazione di iniziative finalizzate alla loro risoluzione.
L'inadeguatezza delle consolari Collatina e Prenestina rende problematico anche l'utilizzo dei due autobus che servono il quartiere (il 314 e lo 055). Il 314 parte da Massa S. Giuliano, a Castelverde, scende lungo la collatina, entra nel quartiere Ponte di Nona per un piccolo tratto fino a Piazza Muggia, dopodichè riprende la Collatina e arriva fino a Largo Preneste. Lo 055 invece parte da Via Conti, gira intorno al parco di Ponte di Nona, riprende la Collatina verso l'esterno, passa per la Stazione di Lunghezza (FS), e dopo un lungo tragitto raggiunge la stazione della metro C Grotte Celoni. Per chi deve recarsi verso la Casilina, invece, c'è lo 056 che ferma all'incrocio tra via del ponte di nona e la prenestina.
I collegamenti ferroviari sono garantiti dalla linea FR2 Tivoli-Guidonia-Tiburtina. La fermata attualmente più vicina al quartiere è quella di Lunghezza, 2km circa, 5 minuti in macchina, 10 minuti in autobus (314 - 055). E' dotata di parcheggio pubblico senza vigilanza, ma lo spazio non è sufficiente per tutta l'autenza. In ogni caso si trova posto nelle strade interne della cittadina di Lunghezza. Il trenino ci mette circa 30 min ad arrivare a Tiburtina, e nelle prime ore mattutine è molto affollato.
Attenzione: questo orario è aggiornato all'inverno 2009. Consultare sempre gli orari aggiornati, per sicurezza, su orario.trenitalia.com .

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Partenze da Lunghezza verso Tiburtina - giorni feriali (durata del viaggio, in media, 30 minuti): 5,44 - 6,21 - 6,39 - 6,56 - 7,09 - 7,28 - 7,47 - 8,08 - 8,39 - 8,58 - 9,28 - 10,06 - 10,28 - 11,06 - 11,28 - 11,45 - 12,02 - 12,28 - 13,19 - 13,28 - 14,17 - 14,28 - 14,43 - 14,59 - 15,28 - 15,58 - 16,15 - 16,28 - 16,58 -17,28 - 18,01 - 18,28 - 19,02 - 19,28 - 19,58 - 20,28 - 20,58 - 22,16.

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Partenze da Tiburtina verso Lunghezza - giorni feriali (durata del viaggio, in media, 30 minuti): 4,54 - 6,44 - 7,03 - 7,19 - 8,10 - 8,30 - 9,03 - 9,31 - 10,05 - 10,31 - 10,46 - 11,01 - 11,31 - 12,05 - 12,31 - 13,01 - 13,31 - 14,01 - 14,31 - 14,41 - 15,01 - 15,31 - 16,01 - 16,31 - 16,46 - 17,03 - 17,31 - 17,45 - 18,01 - 18,37 - 19,01 - 19,31 - 19,43 - 20,01 - 21,01 - 21,16 - 21,31 - 22,01